Медицинская служба была создана на базе Республиканского специализированного отряда по проведению первоочередных аварийно-спасательных работ МВД в 1991 году.
В настоящее время медицинскую службу МЧС образуют 11 подразделений, 6 из которых выезжают для оказания медицинской помощи пострадавшим при чрезвычайных ситуациях, 5 – оказывают амбулаторную медицинскую помощь:

центр медицинского обеспечения РОСН;
медицинская служба Пинского центра РОСН;
медицинская служба ГААСУ «Авиация» МЧС;
медицинские службы пожарных аварийно-спасательных отрядов областных управлений МЧС;
медицинские пункты учреждений образования МЧС.

На сегодняшний день в подразделениях медицинской службы МЧС состоит 80 работников, из них врачей – 45, среднего медицинского персонала – 35.
Специфика деятельности медицинской службы МЧС аналогична деятельности службы скорой медицинской помощи Министерства здравоохранения. Основным отличием является то, что работники медицинской службы МЧС оказывают медицинскую помощь в зоне чрезвычайной ситуации либо в непосредственной близости от нее при воздействии поражающих факторов.
Для обеспечения управления службой, руководством МЧС в октябре 2005 года принято решение о создании центра медицинского обеспечения.
В настоящее время центр медицинского обеспечения включает: сектор медицинской защиты, отдел медицинского обеспечения аварийно-спасательных работ и сектор медико-профилактической работы.
Основными задачами центра медицинского обеспечения являются:

участие в организации и реализации мероприятий медицинской защиты населения;
участие в организации и проведении мероприятий медицинского обеспечения аварийно-спасательных работ;
организация непрерывного обучения работников органов и подразделений по чрезвычайным ситуациям навыкам оказания первой помощи пострадавшим;
участие в организации и проведении комплекса медико-профилактических мероприятий по предупреждению и снижению заболеваемости среди работников.